MTD 243-670 Manual do Utilizador Página 92
- Página / 186
- Índice
- MARCADORES
Avaliado. / 5. Com base em avaliações de clientes
ERGEBNISSE KAPITEL 3
In
Klebsiella pneumoniae wurden sechs Gene identifiziert, die an der Synthese
von PQQ beteiligt sind (Meulenberg
et al., 1992); die Expression von vier Genen
(
pqqACDE) wurde dagegen als hinreichend für die PQQ-Synthese in Acinetobacter cal-
coaceticus
gezeigt. Davon ausgehend wurde spekuliert, daß in K. pneumoniae mögli-
cherweise ein anderes Substrat das Ausgangsprodukt der PQQ-Synthese bildet (Goosen
et al.
, 1989).
Auf Chr.2 in
R. eutropha ist ein Cluster aus vier Genen kodiert (H16_B1052-
1049), der starke Übereinstimmungen in der Sequenz und der Organisation zu den
pqqBCDE-Operons aus Pseudomonas syringae (Buell et al., 2003), R. eutropha
JMP134 und
Burkholderia xenovorans LB400 (beide DOE Joint Genome Institute)
zeigt. Das Gen
pqqA, das in R. eutropha und anderen Organismen fehlt, kodiert für ein
kurzes Peptid von 23 Aminosäuren, das wahrscheinlich als Vorläufer für die PQQ-
Biosynthese dient (Goosen
et al., 1992). Über die Funktion der potentiellen Endopepti-
dase PqqF aus
Klebsiella pneumoniae (Meulenberg et al., 1992), dem zweiten fehlen-
den Gen in
R. eutropha, gibt es keine weiteren Informationen. Stromabwärts vom pqq-
Operon, auf dem gegenüberliegenden Strang, liegt ein Cluster aus drei CDSs, der für
ein potentielles Cytochrom c (H16_B1048), eine potentielle PQQ-abhängige Alkohol-
Dehydrogenase (H16_B1047) und eine Zink-abhängige Metallhydrolase oder Glyoxyla-
se (H16_B1046) kodiert.
3.I.4.4 Kdp-ATPase
Kalium-Ionen spielen ein wichtige Rolle bei der Osmoregulation von Bakterien. Aus
diesem Grund besitzen Bakterien eine Reihe von Influx- und Efflux-Systemen zur Kon-
trolle der K
+
-Konzentration (Stumpe et al., 1996). In Escherichia coli wird das
kdpFABC-Operon unter K
+
-limitierenden Bedingungen und bei hoher Osmolarität des
Mediums induziert (Rhoads
et al., 1976). Es wird als eine Art Notfallsystem angesehen,
das eine K
+
-Versorgung garantiert, wenn eine ausreichende Aufnahme von Kalium-
Ionen durch andere Systeme nicht gewährleistet werden kann (Epstein, 2003). Die Ex-
pression des
kdpFABC-Operons wird durch ein Zwei-Komponenten-Regulationssystem
kontrolliert (
kdpDE), welches direkt stromabwärts identifiziert wurde (Walderhaug et
al.
, 1992).
81
- Inhaltsverzeichnis 3
- Abkürzungsverzeichnis 8
- 1 Einleitung 12
- 2 Material und Methoden 16
- 2.2 Nährmedien und Puffer 17
- 2.2.2 Medienzusätze 17
- 2.3.1 Zellanzucht 18
- 2.3.2 Stammhaltung 20
- 2.4.1 Geräte und Lösungen 20
- 20x TAE-Puffer 22
- 2.4.10 Scheren von DNA 25
- 2.5.1 Restriktion 26
- 2.5.2 Dephosphorylierung 26
- 50 µl Ansatz 27
- 70 µl Ansatz 27
- 2.5.5 Ligation 28
- 2.6.1 TOPO TA-Klonierung 28
- 4 µl Ansatz 29
- 2.7 Amplifikationen 30
- 2.8 Genbanken 33
- 2.8.1 Plasmidbanken 34
- 2.9 Sequenzierung 34
- „½-LGA“-Sequenzieransatz 35
- Stop-Mix 37
- MegaBACE-Sequenzieransatz 37
- 2.11 Lückenschluß 39
- 2.11.1 Primerwalking 39
- 2.11.2 Lückenschluß mit PCR 40
- 2.11.3 Multiplex-PCR 41
- 2.12 BLAST 42
- 2.12.1 Bidirektionaler BLAST 42
- 2.13.3 Annotation in ERGO 44
- 2.14 Kumulativer GC-Skew 46
- 3 Ergebnisse 48
- Pile-ups assemblieren 53
- Pile-ups 53
- Bsp143I 56
- 3.I.1.5 Lückenschluß 58
- 3.I.1.6 Sekundärstrukturen 58
- R. eutropha H16 werden noch 59
- 3.I.2 Sequenzanalyse 60
- 3.I.2.1 G+C-Gehalt 63
- Bu. pseudomallei K96243 65
- Bo. bronchiseptica RB50 65
- 3.I.2.3 RNA-Gene 66
- 3.I.2.5 Annotation 68
- R. eutropha (H16_B1213) 80
- R. eutropha nachge 80
- R. eutropha 81
- et al., 1974) 81
- R. eutropha um zwei weitere 81
- 3.I.4.2.1.4 Acetoin-Abbau 88
- 3.I.4.2.2.1 Cyanat-Hydratase 89
- 3.I.4.2.2.2 Formamidase 89
- 3.I.4.4 Kdp-ATPase 92
- 3.I.4.5 Begeißelung 93
- R. solanacearum, die aller 94
- 5 7 8 9 10 11 126 13 14 96
- 3.I.4.6.2 Potentielle Toxine 97
- 3.I.4.6.2.1 RTX-Toxine 97
- 3.I.4.6.2.2 Tc-Toxine 99
- eutropha iden 100
- 3.II.1.1 Strategieanpassung 101
- 3.II.1.2 Rohsequenzierung 102
- Anzahl der Sequenzläufe 103
- Sequenzlücken 103
- 3.II.1.4 Lückenschluß 104
- 3.II.2 Sequenzanalyse 106
- Deletion 107
- Gene der Methanogenese 108
- Hoch-exprimierte Gene 108
- RNA-Gene 108
- Skalierung 108
- (1998) 110
- ERGEBNISSE KAPITEL 3 111
- Methanogenese 113
- Methanol + H 113
- Msp. stadtmanae 115
- Mth. thermautotrophicus 115
- 3.II.4 CO 117
- -Reduktionsweg 117
- 3.II.5 Genomvergleiche 121
- GKxxxKxNGRT MKNK 129
- DISKUSSION KAPITEL 4 136
- R. eutropha H16 141
- R. eutropha JMP134 141
- R. solanacearum GMI1000 141
- R. metallidurans CH34 141
- R. eutropha H16 C. necator N1 143
- 4.I.10 Ausblick 144
- 4.II.3 Kommensalismus 147
- 4.II.3.1 Zellwandsynthese 148
- 4.II.3.2 Überlange ORFs 150
- 4.II.5 Ausblick 154
- ZUSAMMENFASSUNG KAPITEL 5 155
- Burkholderiaceae 155
- Msp. stadtmanae-spezifischer 157
- 6 Literaturverzeichnis 158
- Lebenslauf 186
Manuais e produtos relacionados com não MTD 243-670
não MTD 242687 Especificações
(88 páginas)
(88 páginas)
não MTD 24677A Manual do Utilizador
(48 páginas)
(48 páginas)
não MTD 114-252A Manual do Utilizador
(100 páginas)
(100 páginas)
não MTD 242-685A Manual do Utilizador
(6 páginas)
não MTD 244-670A Manual do Utilizador
(409 páginas)
(409 páginas)
não MTD 243-670 Manual do Utilizador
(101 páginas)
(101 páginas)
não MTD 243-670 Manual do Utilizador
(144 páginas)
(144 páginas)
não MTD MTD-ERV 350 Especificações
(56 páginas)
(56 páginas)
© 2020, manymanuals-pt.com. Todos os direitos reservados. | 0.110 s |
Manymanuals.com
Manymanuals.de
Manymanuals.fr
Manymanuals.it
Manymanuals.pl
Manymanuals.cz
Manymanuals.es
Manymanuals-pt.com
Comentários a estes Manuais