MTD 243-670 Manual do Utilizador Página 79
- Página / 186
- Índice
- MARCADORES
Avaliado. / 5. Com base em avaliações de clientes
ERGEBNISSE KAPITEL 3
Was den Enzymapparat des ED-Weges in
R. eutropha angeht, so ist eine klare Zuord-
nung verschiedener Bereiche zu den beiden großen Replikons möglich:
• Die Aufnahme und Umsetzung von Fructose und die Umsetzung von Glucose
über den ED-Weg sind vollständig auf Chr.2 und in wesentlichen Bestandteilen
auch ausschließlich auf Chr.2 kodiert (Abb. 3.16). Zu den Genen, die nur auf
Chr.2 vorliegen, gehören das Aufnahme-System für Fruktose, Fructokinase
(EC 2.7.1.4) und Glucokinase (EC 2.7.1.2), 6-Phospho-Gluconolactonase
(EC 3.1.1.31) und KDPG-Aldolase (EC 4.1.2.14).
• Für den Abbau von Gluconat über den ED-Weg wird dagegen die Gluconat-
Kinase (EC 2.7.1.12) benötigt, die ausschließlich auf Chr.1 kodiert sind, ebenso
wie zwei weitere Enzyme, die die Umsetzung von 2-Ketogluconat zu 6-
Phosphogluconat katalysieren (Abb. 3.16). Verschiedene andere Enzyme sind
sowohl auf Chr.1 als auch auf Chr.2 kodiert.
Die Enzyme des ED-Weges sind in
R. eutropha im wesentlichen in fünf Clustern ko-
diert, von denen sich vier auf Chr.2 befinden:
Cluster 1 (Tab. 3.4) weist starke Ähnlichkeit zu dem in
Sinorhizobium meliloti
charakterisierten
frc-Operon auf (Lambert et al., 2001). Cluster 1 kodiert für ein
potentielles Fructose-ABC-Transportsystem (H16_B1498-1500), eine Fructokinase (EC
2.7.1.4, H16_B1503), eine von zwei Phosphoglucose-Isomerasen (EC 5.3.1.9,
H16_B1502) und eine von drei Glucose-6-Phosphat-Dehydrogenasen (EC 1.1.1.49,
H16_B1501). Ob es sich bei Cluster 1 tatsächlich um das für Aufnahme und Umsetzung
von Fructose verantwortliche Operon handelt, wird zur Zeit untersucht (B. Bowien,
persönliche Mitteilung).
Tab. 3.4: Entner-Doudoroff-Weg, Cluster 1 auf Chr.2.
Nr. CDS Gen Annotation EC-Nummer
1 H16_B1497
frcR
a
transcriptional regulator
2 H16_B1498
frcA
a
ABC transporter, ATP-binding protein
3 H16_B1499
frcC
a
ABC transporter, putative fructose permease
4 H16_B1500
frcB
a
putative fructose binding protein
5 H16_B1501
zwf2
glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase 1.1.1.49
6 H16_B1502
pgi2
glucose-6-phosphate isomerase 5.3.1.9
7 H16_B1503
frc
fructokinase 2.7.1.4
a
aus Sinorhizobium meliloti (Lambert et al., 2001).
68
- Inhaltsverzeichnis 3
- Abkürzungsverzeichnis 8
- 1 Einleitung 12
- 2 Material und Methoden 16
- 2.2 Nährmedien und Puffer 17
- 2.2.2 Medienzusätze 17
- 2.3.1 Zellanzucht 18
- 2.3.2 Stammhaltung 20
- 2.4.1 Geräte und Lösungen 20
- 20x TAE-Puffer 22
- 2.4.10 Scheren von DNA 25
- 2.5.1 Restriktion 26
- 2.5.2 Dephosphorylierung 26
- 50 µl Ansatz 27
- 70 µl Ansatz 27
- 2.5.5 Ligation 28
- 2.6.1 TOPO TA-Klonierung 28
- 4 µl Ansatz 29
- 2.7 Amplifikationen 30
- 2.8 Genbanken 33
- 2.8.1 Plasmidbanken 34
- 2.9 Sequenzierung 34
- „½-LGA“-Sequenzieransatz 35
- Stop-Mix 37
- MegaBACE-Sequenzieransatz 37
- 2.11 Lückenschluß 39
- 2.11.1 Primerwalking 39
- 2.11.2 Lückenschluß mit PCR 40
- 2.11.3 Multiplex-PCR 41
- 2.12 BLAST 42
- 2.12.1 Bidirektionaler BLAST 42
- 2.13.3 Annotation in ERGO 44
- 2.14 Kumulativer GC-Skew 46
- 3 Ergebnisse 48
- Pile-ups assemblieren 53
- Pile-ups 53
- Bsp143I 56
- 3.I.1.5 Lückenschluß 58
- 3.I.1.6 Sekundärstrukturen 58
- R. eutropha H16 werden noch 59
- 3.I.2 Sequenzanalyse 60
- 3.I.2.1 G+C-Gehalt 63
- Bu. pseudomallei K96243 65
- Bo. bronchiseptica RB50 65
- 3.I.2.3 RNA-Gene 66
- 3.I.2.5 Annotation 68
- R. eutropha (H16_B1213) 80
- R. eutropha nachge 80
- R. eutropha 81
- et al., 1974) 81
- R. eutropha um zwei weitere 81
- 3.I.4.2.1.4 Acetoin-Abbau 88
- 3.I.4.2.2.1 Cyanat-Hydratase 89
- 3.I.4.2.2.2 Formamidase 89
- 3.I.4.4 Kdp-ATPase 92
- 3.I.4.5 Begeißelung 93
- R. solanacearum, die aller 94
- 5 7 8 9 10 11 126 13 14 96
- 3.I.4.6.2 Potentielle Toxine 97
- 3.I.4.6.2.1 RTX-Toxine 97
- 3.I.4.6.2.2 Tc-Toxine 99
- eutropha iden 100
- 3.II.1.1 Strategieanpassung 101
- 3.II.1.2 Rohsequenzierung 102
- Anzahl der Sequenzläufe 103
- Sequenzlücken 103
- 3.II.1.4 Lückenschluß 104
- 3.II.2 Sequenzanalyse 106
- Deletion 107
- Gene der Methanogenese 108
- Hoch-exprimierte Gene 108
- RNA-Gene 108
- Skalierung 108
- (1998) 110
- ERGEBNISSE KAPITEL 3 111
- Methanogenese 113
- Methanol + H 113
- Msp. stadtmanae 115
- Mth. thermautotrophicus 115
- 3.II.4 CO 117
- -Reduktionsweg 117
- 3.II.5 Genomvergleiche 121
- GKxxxKxNGRT MKNK 129
- DISKUSSION KAPITEL 4 136
- R. eutropha H16 141
- R. eutropha JMP134 141
- R. solanacearum GMI1000 141
- R. metallidurans CH34 141
- R. eutropha H16 C. necator N1 143
- 4.I.10 Ausblick 144
- 4.II.3 Kommensalismus 147
- 4.II.3.1 Zellwandsynthese 148
- 4.II.3.2 Überlange ORFs 150
- 4.II.5 Ausblick 154
- ZUSAMMENFASSUNG KAPITEL 5 155
- Burkholderiaceae 155
- Msp. stadtmanae-spezifischer 157
- 6 Literaturverzeichnis 158
- Lebenslauf 186
Manuais e produtos relacionados com não MTD 243-670
não MTD 242687 Especificações
(88 páginas)
(88 páginas)
não MTD 24677A Manual do Utilizador
(48 páginas)
(48 páginas)
não MTD 114-252A Manual do Utilizador
(100 páginas)
(100 páginas)
não MTD 242-685A Manual do Utilizador
(6 páginas)
não MTD 244-670A Manual do Utilizador
(409 páginas)
(409 páginas)
não MTD 243-670 Manual do Utilizador
(101 páginas)
(101 páginas)
não MTD 243-670 Manual do Utilizador
(144 páginas)
(144 páginas)
não MTD MTD-ERV 350 Especificações
(56 páginas)
(56 páginas)
© 2020, manymanuals-pt.com. Todos os direitos reservados. | 0.100 s |
Manymanuals.com
Manymanuals.de
Manymanuals.fr
Manymanuals.it
Manymanuals.pl
Manymanuals.cz
Manymanuals.es
Manymanuals-pt.com
Comentários a estes Manuais