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ERGEBNISSE KAPITEL 3

Zu den Genen für das Tc-Toxin TcdA1 und die Potentiatoren TcdB1 und TccC1

konnten analoge CDSs in einem Cluster auf Chr.2 identifiziert werden (Abb. 3.22). Im

Gegensatz zu

Photorhabdus luminescens sind TcdB und TccC in R. eutropha aber in-

nerhalb einer einzigen CDS kodiert (H16_B1352), die N-terminale Ähnlichkeit zu

tcdB

und C-terminale Ähnlichkeit zu

tccC aufweist. Daß es sich bei dem in R. eutropha iden-

tifizierten Gen aller Wahrscheinlichkeit nach um eine echte kodierende Sequenz han-

delt, wird durch die Existenz einer CDS in

Pseudomonas syringae CD3000 bestätigt,

die zwar eine geringe Identität auf Proteinebene (29 %), aber eine ähnliche Länge wie

H16_B1352 zeigt (tr|Q87X46; Buell

et al., 2003). Bei tcdA (H16_B1353), dem zweiten

potentiellen

tc-Gen aus R. eutropha, handelt es sich um die größte in R. eutropha identi-

fizierte CDS überhaupt (3395 AA). Dieses Gen weicht in Sequenz und Länge insbeson-

dere des N-Terminus von allen bisher gefundenen

tc-Genen ab. Obwohl inzwischen ge-

zeigt wurde, daß

tc-Gene unter Gram-negativen Bakterien weit verbreitet sind

(Waterfield

et al., 2001), existieren in den Datenbanken keine Einträge anderer β-

Proteobakterien mit signifikanter Ähnlichkeit zu den potentiellen

tc-Genen aus

R. eutropha.

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