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ERGEBNISSE KAPITEL 3

Abb. 3.10: Kumulative GC-Skew-Analyse von Chr.1 aus R. eutropha nach Grigoriev

(1998).

Ähnlich wie R. solanacearum besitzt R. eutropha zwei unterschiedliche Typen der Ori-

gins of replication

, einen chromosomalen oriC auf Chr.1 sowie zwei plasmidäre oriV

auf Chr.2 und pHG1:

Der chromosomale Replikationsursprung fällt in Bakterien i.d.R. in eine intergeni-

sche Region in direkter Nachbarschaft einer CDS für das DnaA-Protein, das mit der In-

itiation der Replikation in Verbindung gebracht wird (Messer, 2002). Die Replikation

selbst wird durch Bindung von DnaA an repetitive, nicht palindromische, nonamere Se-

quenzen in der

oriC-Region initialisiert. Auf Chr.1 ist am globalen Minimum des kumu-

lativen

GC-Skews ein Gen (H16_A0001) mit 88 % Identität zu dnaA aus

R. solanacearum lokalisiert. In unmittelbarer Nachbarschaft stromaufwärts von dnaA

befinden sich außerdem zwei potentielle DnaA-Bindestellen (

TTATCCACA), die Ähn-

lichkeiten zu der Modell-Bindestelle aus

E. coli aufweisen (Fuller et al., 1984). In der

Umgebung von

dnaA sind Proteine der genetischen Informationsprozessierung kodiert:

Stromaufwärts werden die DnaA-Bindestellen von einem Protein der kleinen ribosoma-

len Untereinheit (L34P, H16_A3747) und einer Untereinheit der tRNA-prozessierenden

Ribonuklease P (H16_A3746) flankiert. Stromabwärts von

dnaA sind eine β-

Untereinheit der DNA-Polymerase III (EC 2.7.7.7, H16_A0002), eine β-Untereinheit

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