MTD 243-670 Manual do Utilizador Página 86
- Página / 186
- Índice
- MARCADORES
Avaliado. / 5. Com base em avaliações de clientes
ERGEBNISSE KAPITEL 3
Der vollständige Abbau von Phenol über Catechol zu Pyruvat und Acetyl-CoA
durch
Tab. 3.12: Abbau aromatischer Kohlenwasserstoffe über den meta-Spaltungs-Weg, CDSs
den
meta-Spaltungs-Weg ist in einem einzigen Cluster kodiert (Tab. 3.12,
Abb. 3.19), der starke Ähnlichkeit zum
dmp-Operon aufweist, das in diesem Zusam-
menhang auf dem Megaplasmid pVI150 in
Pseudomonas sp. CF600 charakterisiert
wurde (Shingler
et al., 1992). Ein weiterer Cluster kodiert möglicherweise für die En-
zyme zum Abbau von Biphenyl über den
meta-Spaltungs-Weg. Einige CDSs weisen
Ähnlichkeiten zu Genen des in
Burkholderia xenovorans LB400 charakterisierten bph-
Operons auf (Hofer
et al., 1994).
auf Chr.2.
Nr. CDS Gen Annotation EC-Nummer
1. Abbau von Phenol über meta-Spaltung
1 H16_B0535 transcriptional regulator, LysR family
2 H16_B0536
catB2
muconate cyclo-isomerase 5.5.1.1
3 H16_B0537
putative exported protein
4 H16_B0538
dmpK
b
activator of phenol-degradative genes
5 H16_B0539
dmpL
b
tein 1.14.13.7 phenol hydroxylase P0 pro
6 H16_B0540
dmpM
b
phenol hydroxylase P1 protein 1.14.13.7
7 H16_B0541
dmpN
b
phenol hydroxylase P2 protein 1.14.13.7
8 H16_B0542
dmpO
b
phenol hydroxylase P3 protein 1.14.13.7
9 H16_B0543
dmpP
b
phenol hydroxylase P4 protein 1.14.13.7
10 H16_B0544
dmpQ
b
phenol hydroxylase P5 protein 1.14.13.7
11 H16_B0545
dmpB
b
2Fe-2S ferredoxin
12 H16_B0546
dmpC
b
catechol 2,3-dioxygenase 1.13.11.2
13 H16_B0547
dmpE
b
2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase 1.2.1.32
14 H16_B0548
dmpH
b
2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase 4.2.1.80
15 H16_B0549
dmpI
b
4-oxalocrotonate decarboxylase 4.1.1.77
16 H16_B0550
dmpF
b
4-oxalocrotonate tautomerase 5.3.2.-
17 H16_B0551
dmpG
b
acetaldehyde dehydrogenase 1.2.1.10
18 H16_B0552
dmpK
b
4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase 4.1.3.-
2. wa A ohrscheinlich bbau v n Biphenyl über meta-Spaltung
1 H16_B0600
bphD
2,6-dioxo-6-phenylhexa-3-enoate hydrolase 3.7.1.8
2 H16_B0599
oxidoreductase short-chain dehydrogenase
3 H16_B0598
hypothetical membrane associated protein
4 H16_B0597
bphH
4.2. .80 2-oxopent-4-enoate hydratase 1
5 H16_B0596
acetaldehyde dehydrogenase 1.2.1.10
6 H16_B0595
bphI
4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase 4.1.3.-
3 in a m A altung . E zelnes Gen us de bbau von Biphenyl über meta-Sp
H16_B0654
bphC
1. 9 biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase 13.11.3
a
aus Acinetobacter lwoffi K24 (Kim et al., 1998).
b
).
aus s 60
c
aus Burkholderia xenovorans (Hofer et al., 1994
Pseudomona sp. CF 0 (Shingler et al., 1992).
75
- Inhaltsverzeichnis 3
- Abkürzungsverzeichnis 8
- 1 Einleitung 12
- 2 Material und Methoden 16
- 2.2 Nährmedien und Puffer 17
- 2.2.2 Medienzusätze 17
- 2.3.1 Zellanzucht 18
- 2.3.2 Stammhaltung 20
- 2.4.1 Geräte und Lösungen 20
- 20x TAE-Puffer 22
- 2.4.10 Scheren von DNA 25
- 2.5.1 Restriktion 26
- 2.5.2 Dephosphorylierung 26
- 50 µl Ansatz 27
- 70 µl Ansatz 27
- 2.5.5 Ligation 28
- 2.6.1 TOPO TA-Klonierung 28
- 4 µl Ansatz 29
- 2.7 Amplifikationen 30
- 2.8 Genbanken 33
- 2.8.1 Plasmidbanken 34
- 2.9 Sequenzierung 34
- „½-LGA“-Sequenzieransatz 35
- Stop-Mix 37
- MegaBACE-Sequenzieransatz 37
- 2.11 Lückenschluß 39
- 2.11.1 Primerwalking 39
- 2.11.2 Lückenschluß mit PCR 40
- 2.11.3 Multiplex-PCR 41
- 2.12 BLAST 42
- 2.12.1 Bidirektionaler BLAST 42
- 2.13.3 Annotation in ERGO 44
- 2.14 Kumulativer GC-Skew 46
- 3 Ergebnisse 48
- Pile-ups assemblieren 53
- Pile-ups 53
- Bsp143I 56
- 3.I.1.5 Lückenschluß 58
- 3.I.1.6 Sekundärstrukturen 58
- R. eutropha H16 werden noch 59
- 3.I.2 Sequenzanalyse 60
- 3.I.2.1 G+C-Gehalt 63
- Bu. pseudomallei K96243 65
- Bo. bronchiseptica RB50 65
- 3.I.2.3 RNA-Gene 66
- 3.I.2.5 Annotation 68
- R. eutropha (H16_B1213) 80
- R. eutropha nachge 80
- R. eutropha 81
- et al., 1974) 81
- R. eutropha um zwei weitere 81
- 3.I.4.2.1.4 Acetoin-Abbau 88
- 3.I.4.2.2.1 Cyanat-Hydratase 89
- 3.I.4.2.2.2 Formamidase 89
- 3.I.4.4 Kdp-ATPase 92
- 3.I.4.5 Begeißelung 93
- R. solanacearum, die aller 94
- 5 7 8 9 10 11 126 13 14 96
- 3.I.4.6.2 Potentielle Toxine 97
- 3.I.4.6.2.1 RTX-Toxine 97
- 3.I.4.6.2.2 Tc-Toxine 99
- eutropha iden 100
- 3.II.1.1 Strategieanpassung 101
- 3.II.1.2 Rohsequenzierung 102
- Anzahl der Sequenzläufe 103
- Sequenzlücken 103
- 3.II.1.4 Lückenschluß 104
- 3.II.2 Sequenzanalyse 106
- Deletion 107
- Gene der Methanogenese 108
- Hoch-exprimierte Gene 108
- RNA-Gene 108
- Skalierung 108
- (1998) 110
- ERGEBNISSE KAPITEL 3 111
- Methanogenese 113
- Methanol + H 113
- Msp. stadtmanae 115
- Mth. thermautotrophicus 115
- 3.II.4 CO 117
- -Reduktionsweg 117
- 3.II.5 Genomvergleiche 121
- GKxxxKxNGRT MKNK 129
- DISKUSSION KAPITEL 4 136
- R. eutropha H16 141
- R. eutropha JMP134 141
- R. solanacearum GMI1000 141
- R. metallidurans CH34 141
- R. eutropha H16 C. necator N1 143
- 4.I.10 Ausblick 144
- 4.II.3 Kommensalismus 147
- 4.II.3.1 Zellwandsynthese 148
- 4.II.3.2 Überlange ORFs 150
- 4.II.5 Ausblick 154
- ZUSAMMENFASSUNG KAPITEL 5 155
- Burkholderiaceae 155
- Msp. stadtmanae-spezifischer 157
- 6 Literaturverzeichnis 158
- Lebenslauf 186
Manuais e produtos relacionados com não MTD 243-670
não MTD 242687 Especificações
(88 páginas)
(88 páginas)
não MTD 24677A Manual do Utilizador
(48 páginas)
(48 páginas)
não MTD 114-252A Manual do Utilizador
(100 páginas)
(100 páginas)
não MTD 242-685A Manual do Utilizador
(6 páginas)
não MTD 244-670A Manual do Utilizador
(409 páginas)
(409 páginas)
não MTD 243-670 Manual do Utilizador
(101 páginas)
(101 páginas)
não MTD 243-670 Manual do Utilizador
(144 páginas)
(144 páginas)
não MTD MTD-ERV 350 Especificações
(56 páginas)
(56 páginas)
© 2020, manymanuals-pt.com. Todos os direitos reservados. | 0.073 s |
Manymanuals.com
Manymanuals.de
Manymanuals.fr
Manymanuals.it
Manymanuals.pl
Manymanuals.cz
Manymanuals.es
Manymanuals-pt.com
Comentários a estes Manuais